Избор материјала за муфлну пећ је директно везан за његову отпорност на високе температуре, механичку чврстоћу, хемијску стабилност и термичку ефикасност. Традиционалне муфлне пећи углавном користе материјале отпорне на високе температуре као што су ватросталне цигле и силицијум карбид за изградњу пећи и тела пећи, иако ови материјали имају добру отпорност на високе температуре, али постоје ограничења у механичкој чврстоћи, стабилности топлотног удара и отпорности на хемијске нападе . Због тога је у дизајну нове муфлне пећи избор материјала посебно важан.
Последњих година, уз континуирани развој високотемпературних конструкцијских материјала и композитних материјала, у производњу муфлних пећи уведена је серија материјала високих перформанси. На пример, легуре на високим температурама, керамички композити и специјална стакла не само да имају одличну отпорност на високе температуре, већ и одличну механичку чврстоћу, отпорност на термички удар и хемијску стабилност. Поред тога, примена нових материјала као што су наноматеријали и технологија превлаке такође доноси нове могућности за побољшање перформанси муфлних пећи.